Syuting film ini mulai dilakukan pada Mei 2007 dengan mengambil lokasi di Chennai, yang kemudian dilanjutkan di lokasi lainnya termasuk Bangalore, Cape Town, Deadpan Desert dan Mumbai. Film ini sendiri menjadi ajang totalitas bagi Aamir Khan untuk 'menciptakan' karakter yang ia perankan tersebut, di mana dia telah menghabiskan satu tahun di pelatihan gym untuk perannya. Film ini juga merupakan debut film Bollywood untuk Asin. Saat berita ini ditulis, Ghajini versi baru ini berhasil menempati urutan ketujuh sebagai film Bollywood terlaris di seluruh dunia. Dan ketika dirilis di tahun 2008, film ini menjadi film India terlaris sepanjang masa sebelum akhirnya dikalahkan oleh film Aamir Khan lainnya; 3 Idiots (2009).
Alur Cerita
Sunita (Jiah Khan), seorang mahasiswa Fakultas Kedokteran bersama dengan teman-temannya sedang mengerjakan sebuah proyek anatomi pada otak manusia. Dia ingin menyelidiki kasus aneh dari Sanjay Singhania (Aamir Khan), seorang mantan pengusaha terkemuka di kota Mumbai yang dilaporkan memiliki gejala anti retrogade amnesia, yaitu kehilangan ingatan dalam jangka pendek. Dosen dari Sunita, Dr. Debkumar Mitra (Anjum Rajabali), sebenarnya melarang untuk mengakses catatan Sanjay karena saat ini dia sedang dalam penyelidikan kriminal, namun Sunita tetap memutuskan untuk menyelidikinya.
Sanjay kemudian diperkenalkan saat dia dengan brutal membunuh seorang pria, di mana dia mengambil foto orang itu dengan kamera polaroid, dan menulis "dilakukan" di atas fotonya. Hal ini menunjukkan bahwa Sanjay mengalami anterograde amnesia, yang kehilangan memorinya setiap 15 menit, dan dia menggunakan foto-foto, catatan, dan tato di tubuhnya untuk memulihkan ingatannya setelah siklus yang dialami. Hal ini juga menunjukkan bahwa Sanjay melakukan semua itu untuk membalas dendam atas kematian kekasihnya, Kalpana Shetty (Asin Thottumkal), dan secara sistematis ia membunuh orang yang bertanggung jawab atas kematiannya. Target utamanya adalah Ghajini Dharmatma (Pradeep Rawat), salah satu orang yang berpengaruh di kota.
Arjun Yadav (Riyaz Khan), seorang inspektur polisi kasus pembunuhan kemudian menuju apartemen Sanjay, hingga dia dapat melumpuhkannya dan kemudian menemukan dua buku harian di mana Sanjay telah mencatat rentetan peristiwa tahun 2005 dan 2006. Film pun beralih ke tahun 2005 saat Yadav membaca buku tersebut: Sanjay ditampilkan sebagai pemilik perusahaan telepon seluler Air Voice. Dan dalam perjalanan bisnisnya, Sanjay mengirim asistennya untuk memenuhi seorang model yang masih dalam tahap perjuangan bernama Kalpana untuk meminta ijin memasang papan reklame di atas apartemennya. Pemilik perusahaan periklanan Kalpana, Satveer Kohli (Tinnu Anand), yang salah menginterpretasikan ini sebagai hubungan asmara, dan juga mengingat kampanye iklan Air Voice mungkin dapat menguntungkan bagi perusahaannya, dia mendorong Kalpana untuk menerimanya. Kalpana yang menganggap ini sebagai lelucon tak bersalah, dan mungkin ini dapat membuat karirnya menjadi lebih baik seperti rekan modelnya, Sonal (Sonal Sehgal), dia akhirnya memutuskan untuk memproklamirkan dirinya sebagai kekasih Sanjay. Begitu Sanjay tahu masalah ini, ia segera memutuskan untuk menghadapi Kalpana. Namun ketika melihat Kalpana sedang membantu gadis cacat untuk melintasi teralis selokan, dia menjadi jatuh cinta padanya. Dengan demikian, ia terpaksa memperkenalkan dirinya sebagai Sachin, hingga keduanya sering bersama dan secara bertahap telah mengembangkan keinginan terhadap satu sama lain. Buku harian berakhir dengan Sanjay yang menyatakan cinta kepada Kalpana, dan berjanji akan mengungkapkan dirinya sebagai Sanjay Singhania.
Ketika Yadav akan membaca buku harian tahun 2006, Sanjay yang kembali sadar segera menyerang dan mengikatnya. Dia kemudian datang ke acara festival budaya perguruan tinggi di mana Ghajini sebagai tamu kehormatan. Sanjay pun mengambil foto Ghajini dan memutuskan untuk membunuhnya. Ia kemudian bertemu Sunita pada acara festival tersebut dan setelah beberapa obrolan, dia memutuskan untuk berteman dengannya. Di malam itu juga, Sanjay keliru menyerang dan membunuh salah satu antek Ghajini di tempat parkir. Ghajini yang bingung dan tidak dapat mengingat kejadian yang telah ia lakukan dua tahun sebelumnya, memutuskan untuk menemukan dan membunuh semua musuhnya satu per satu, namun Sanjay tidak ada di antara mereka.
Sementara itu, Sunita yang mengunjungi apartemen Sanjay menemukan Yadav terikat dan segera membebaskannya. Dia kemudian menemukan dua buku harian Sanjay, dan setelah Yadav mengatakan kepadanya bahwa Sanjay adalah seorang pembunuh, dia belajar bahwa Ghajini adalah target utamanya. Sanjay pun tiba, namun dia tidak ingat siapa mereka dan segera mengejar keduanya. Dalam pengejaran itulah, Yadav tertabrak bus sementara Sunita berhasil lolos setelah masuk ke dalam sebuah butik. Percaya Ghajini dalam bahaya, Sunita segera memberitahu kepadanya bahwa Sanjay telah berencana untuk membunuhnya. Sementara itu, di asramanya, Sunita membaca buku harian Sanjay. Cerita film pun kembali ke tahun 2005 dengan cepat, dan kemudian berlanjut ke tahun 2006. Hal ini menunjukkan bahwa Kalpana telah menerima lamaran Sanjay. Namun karena belum tepat untuk mengaku kepada kekasihnya siapa dirinya sebenarnya, Sanjay terpaksa meneruskan perannya sebagai Sachin, dan buku harian tiba-tiba berakhir.
Mengetahui Sanjay telah ditangkap oleh pihak berwenang dan berada dalam perawatan rumah sakit, Ghajini bersama orang-orangnya pun tiba di sana. Namun dia tidak membunuhnya, hanya menghancurkan semua foto, catatan dan goresan dari tato Sanjay. Puas bahwa ia telah menetralkan Sanjay dengan menghapus jejak yang menghubungkan kepadanya, Ghajini kemudian pergi meninggalkannya.
Sementara untuk menyelidiki cerita Sanjay lebih lanjut, Sunita menemukan bahwa Kalpana sedang melakukan perjalanan ke Goa untuk syuting iklan dengan kereta api ketika ia melihat 25 gadis muda yang tidak bersalah diperdagangkan ke Goa. Dia berhasil menyelamatkan para gadis tersebut dan menemukan bahwa Ghajini ada di balik semua ini. Ghajini kemudian membunuh dua dari 25 gadis yang telah mengenali dirinya dan berencana untuk membunuh Kalpana. Ketika Ghajini bersama antek-anteknya masuk ke apartemen Kalpana dan menunggunya untuk kembali, Sanjay juga tiba di sana. Kata terakhir Kalpana kepada Sanjay adalah "Ghajini". Para antek segera menyerang Kalpana, di mana Sanjay sempat campur tangan sebelum Ghajini memukul kepalanya dengan tongkat besi. Sanjay yang sudak tidak berdaya kemudian menyaksikan Ghajini dengan brutal membunuh kekasihnya dengan batang besi.
Setelah menyadari kebenarannya, Sunita menemui Sanjay di rumah sakit dan memberikan buku hariannya untuk memberitahu kebenarannya. Setelah membacanya, Sanjay menjadi murka dan Sunita bersedia membawanya ke hadapan Ghajini. Sesampainya di sarang Ghajini di pusat kota Mumbai, Sanjay menghadapi semua antek Ghajini dan dengan kekuatannya dia berhasil melumpuhkan mereka semua. Menyadari bahwa ia tidak mampu menghadapi kekuatan Sanjay, Ghajini akhirnya melarikan diri. Keduanya pun terlibat dalam pengejaran sampai Sanjay kembali kehilangan ingatannya. Melihat hal ini, Ghajini berbalik dan menusuknya, di mana dia akan menunjukkan bagaimana dia telah membunuh Kalpana terhadap Sunita. Saat itulah, Sanjay menggunakan kekuatan terakhirnya dan akhirnya dapat mengalahkan Ghajini. Sanjay kemudian membunuhnya dengan cara yang sama seperti Ghajini membunuh kekasihnya.
Film berakhir dengan Sanjay yang masih mengalami amnesia di sebuah yayasan panti asuhan milik Kalpana. Sunita kemudian datang dengan memberikannya hadiah, sebuah lempengan semen jejak kaki Kalpana dan Sanjay ketika pertamakalinya pasangan tersebut menginjakkan kaki mereka ke apartemen baru Kalpana.
